قام ممثل التاج الإسباني فرانسيسكو دي توليدو بإعادة تنظيم الدولة خلال السبعينيات من القرن السادس عشر، فقد اعتمد على إجبار على العمل، حيث كان استخراج الفضة النشاط الاقتصادي الرئيس في البلاد.
ينطبق هذا الأمر على الأساقفة 52 في البلاد فضلاً عن بعض الكهنة الذين تقع أبرشياتهم في المدن والقرى على طول الحدود.
أدى ذلك إلى موت حاكم الإنكا وأغلب أفراد عائلته بالإضافة إلى وريثه، وهو ما أدى إلى انهيار نظام الإنكا السياسي واندلاع بين الأخوين أتوالبا.
تتلقى الكنيسة الكاثوليكية معاملة تفضيلية في مجالات التعليم والمزايا الضريبية وهجرة العمال الدينيين ومجالات أخرى وفقاً للاتفاق.